マイクラのプログラムの読み方がむずいのです！
簡単な理解の仕方教えて！

「マイクラ」をgriffpatch氏のPaper Minecraft v11.6 (Minecraft 2D)のことだと解釈します。
結論から言うと「高度すぎて説明は無理」でしょう。
こちらのプロジェクトはブロックが19238個もあります。これらの全貌を説明するのはもう無理でしょう。「見て自分で考えて」としか言えません。
また、様々なアルゴリズムの知識も必要になってきます。「マップ生成を行う」だけを取ってきても複雑なアルゴリズムがいくつも必要になってきます。これらの多くの知識についても説明していっても長文すぎて誰も読めないでしょう。

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　

こちらで「お約束」を読むように言われたと思いますが、読んだでしょうか。このルールに従うと一般的な質問はこちらで行わなければいけないことになるので、次回、質問するときはそちらでお願いします。

このルールはトピックを作ることに対して非常に厳しく、ほとんどの場合はトピックを作ってもルールに合わないです。実際、直近で作られたトピック1000個を取ってきてもルールに適合するのは多くても十数個だと思います。このルールに合ったトピックを作ることは非常に難しいんです。基本「トピックは作らない」ようにしてください。